一般双方史料对不上，多是纠结于彼此的胜败，但很少有一方完全不承认一场战役的发生。究竟谁是谁非，只好暂且搁置，留待有水平的高手来解迷。这里且按清官方资料编集成的《清耆献类征选编》和《清史稿》的记载叙事。
洛讬一行于当年农历五月抵达后，充分吸取海战失败的教训，避开郑氏水军，寻找空子，又一次成功的从薄弱处抢滩登上厦门岛。但战术的成功却不过再次证明了满人在陆地上已不是汉人对手。
正黄旗一等护卫（从三品）纳穆桑额率本翼兵为前锋与正蓝旗长史（正三品）穆舍刚一登岸，就被迎头痛击，二人及部队全灭。另一路，由正黄旗署参领沙纳哈所率的前锋队也遭痛击，他自己脸上中了两箭，脖子上挨了一箭。血流如注不成人样，被败兵架回，算是拣了一条命。
正白旗署参领鄂满因有上次参战的经验，充作带路前锋，趁郑军不备跃船登岸，“斩馘甚众”，猝不及防的郑兵一度“却入水”。
护军校季达礼（正黄旗包衣）涉水追杀，郑兵复将之引上岸，使之“岸颓”被杀。郑军反击，正白旗参领尼什哈、护军校印得礼、正红旗护军校莫洛洪（与一等子爵莫洛浑是两个人）、正黄旗前锋参领聂鲁库、一等侍卫阿哈丹、二等侍卫岱穆以及罪恶累累的鄂满全部丧命，满军再度大败，无论陆战还是海战，满洲八旗竟都都不是郑军对手。
洛讬、达素收不了场，只得以“寻闻成功死”为讳败之由，“师引还”。《清史稿》的洛讬传却大言不惭“十七年，命为安南将军，征郑成功，大破之。
十一月，还。”这也难怪后人魏源在编修马屁著作《圣武记》时，因太多史事对不上号，架不住痛批起朝廷官史“言胜不言败，书功不书罪”的把戏。
这一仗，不算蒙古八旗和汉军八旗，光是奏折上列出姓名职务的满洲阵亡将官，就达82人
厦门大战，深刻的改变了清廷内部的力量对比。因为阵亡的82名满洲将佐之中，苏克萨哈领导的白旗系（正白、镶白、正蓝旗）占63.4%，两黄旗系只占22%。
而且最反应兵员损失的三品以下的中基层将佐，以白旗系最多（65%），黄旗系只占18%，可见不论什么标准，白旗系损失都是黄旗系三倍。特别是参领一级，白旗系占了绝对多数。
因为这场惨败，白旗系威名扫地，镶白旗护军统领赖塔被夺职，并削去爵位。镶白旗都统索浑连命都没保住，直接死了。二者长期以来的力量平衡，从此被打破了。
厦门覆军对一向以武力而自豪的满清造成了一系列严重影响。。。。。。。
首先，厦门覆军对满洲民心士气的打击极为深远，有的阵亡将校的家属自杀殉夫，如《顺治实录》就记载了佐领琉助的妻子自杀，被朝廷授予烈妇。而满洲兵也没了以往的心气，厌战日甚。清方史料虽对满兵损失人数讳莫如深。
但种种迹像印证着损失的巨大，因而迫使清廷不得不做出一系列反常的举动。厦门之战后仅三个月，八月，清廷竟“议弃舟山地”，将这个反复争夺近十年、付出沉重代价，费了九牛二虎之力才稳固下来的海防要地白白让出。
置浙东宁波、绍兴以至杭州等大郡暴露于威胁于不顾，而原定在此驻守的明安达理的满、蒙部队被调回京城，可见八旗的空虚，到了不得不放弃浙江海防的地步。其后，吴三桂请求对逃亡缅甸的永历政权作最后一击，清廷竟穷得只好让爱星阿带着以蒙古八旗为主体的部队赴云南。
至于对郑成功，清廷不得不完全放弃了以武力进行征服的幻想，改为玩弄“以汉制汉”的伎俩。残余满军全部调回，防地空出，改令靖南王耿继茂停赴广西，“率领全标官兵并家口移驻福”，“凡兵机事务，悉听王调度”。实际上将福建做为耿氏地盘，换取耿家去对冲郑氏。耿氏也不傻，改行招抚政策，专以诱降分化郑氏，一边养蓄实力。久之又酿成耿氏日益坐大于福建，日后参加三藩之乱的祸事。
康熙三年，清廷转而集中力量，剿灭内陆最后一股抗清复明力量：夔东十三家。这本是一支孤立无援，已渐趋衰落的对手，清廷除投入三省数万绿营之外，出动的满军阵容之豪华：靖西将军、工部大臣兼镶黄旗都统穆里玛（鳌拜之弟）、定西将军兼正黄旗都统图海、正红旗都统觉罗巴尔布。
辅国公兼正蓝旗都统穆琛、镶红旗副都统贺布索。以及西安将军傅喀禅、镶红旗副都统杜敏；正黄旗护军统领孙达理、正蓝旗护军统领科尔昆。也就是说，清廷对一支平时并不太重视的孤立之敌。
竟出动了四个完整的满洲旗、两支满洲护军旗，外加大半满洲镶红旗的人马！比过去征李自成、征弘光政权、征李定国这些命运决战的阵容还强。这足以证明满洲各旗此时损耗过大，严重不满员，才需要动用如此多的番号。
更值得玩味的是，顺治于十八年刚死，尸骨未寒，就有一人迫不及待跳出来尽杀郑芝龙全家，而且是冒着矫诏的大罪。此人不是别人，正是白旗系首领苏克萨哈。
其实从清廷大局来说，当时郑成功东进台湾，放弃了经略内地的打算，而留在厦门的郑部与在台的郑成功日渐离心离德，内部出现裂痕，在相当长一段时间里的，整个郑氏集团将处于调整期。
这也可以算是清廷招诱、分化的机会，没必要将事情做绝。
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